邓州处于河南省西南部南襄盆地中部偏西地区。东接南阳市卧龙区、新野县；西连淅川县；南界湖北省襄阳市、老河口市；北邻内乡县、镇平县。地理坐标为北纬32°22′—32°59′， 东经111°37′—111°20′之间。南北长69公里，东西宽67公里，总面积2369平方公里，“山少岗多平原广”为邓州市的地貌特点。邓州地势西北高东南低，西部的朱连山（海拔469.7米）为全市最高点，最低处海拔85米。境内有大小河流29条。这些河流分别从北部或西部入境，汇集于东南部，注入白河，流入汉水。河流冲积形成平原，在北部、中部和东部形成大面积肥沃土地。土层深厚，土质为保水保肥性能强的潮土、黄老土和黑老土。
河流
湍河：发源于伏牛山腹地宝天曼的西北巅，出内乡县后于罗庄乡岑子村流入邓州境内。
刁河：即南北朝时期北魏郦道元名著《水经注》中的朝水，因水势迅猛而得名，发源于内乡县庙岗乡滚子岭，流经内乡县、淅川县、邓州市、新野县四县。唐德宗贞元十三年,吴少诚所开刁沟即此。又名文明河，距州西十五里，旧开小堰，引灌外城壕。
涅水：俗名“赵河”，源自镇平县岐棘山（五朵山），经涅阳故城南（今穰东镇），又东南经安众故城西，在东李洼村与严陵河交汇一同流入于湍河，东晋咸和七年，桓宣破石勒大将郭敬于涅水，就是此地。
严陵河：源自镇平县五朵山，流经百余里，在白牛乡娘娘庙村与赵河交汇，世传严子陵曾钓于此。
沐河：又称默河，源自镇平县五朵山,经过马山口镇、王店镇、灌涨镇、最终在罗庄镇境内流入湍河，相传光武帝得龙马浴于此，故名。
茱萸河：源自禹山，东南流经古代冠军县界，又东南径邓州南境而入新野县界，流经的主要乡镇有彭桥镇和陶营乡。
排子河：源自杏儿山，经林扒镇，过襄樊界，最终汇入白河，流进汉水。
爬鱼河：又名扒淤河或扒鱼河，古名曲河，源自内乡县，在曲河铺（今文曲乡）汇入湍河。
山脉
灵山：位于内乡县南，邓州西北。
禹山：位于西南部，山上有禹王庙，山下有龙潭，相传大禹治水时曾在此山驻扎，故名禹山。西5公里为上禹山，山上也有大禹庙。
覆釜山：又名土谷山。《明嘉靖南阳府志校注》记载：“土釜山在（内乡）县东南二十里，与孤峰山相对，其形上锐下广，如覆釜之状。县志俗呼吐雾山，南属邓州，北属内乡。”明嘉靖《邓州志》载：“其山峰不甚耸起，如覆釜然。上有清禅寺，其右为五龙泉，水四时不竭。山左有先主山，上有先主庙。右为鳌峰山，峰左有济源泉，北为界山，有雅祖洞。”现在的寺庙、泉、洞都无影无踪了。唐代诗人钱起先后两次到清禅寺，写下了《春晚寻覆釜山》和《登覆釜山遇真人》两首诗。
洞儿山：俗称杏儿山、杏山，位于邓州西南约50公里，绵延数5公里，北抵三尖山，古代有许多山洞，相传孟琪曾在此用兵。
析隈山：位于邓州南35公里，《名胜志》左传僖公二十五年，秦人过析隈，因记其地而名山。
气候
邓州属亚热带季风型大陆性气候，受季风转换影响，四季更迭分明，温暖湿润。年平均降水量723毫米左右，年平均气温15.1℃左右，年平均日照1935小时，无霜期平均为229天。
资源
优越的自然环境为农业发展提供了良好条件。盛产小麦、玉米、绿豆、黄豆、红薯、棉花、烟叶、芝麻、花生等粮食和经济作物，年粮食总产7亿公斤以上，棉花总产3500万公斤，烟叶总产2000万公斤，花生1000万公斤，为全国50个商品粮基地县之一，并被国家确定为优质棉基地县（市），是河南省油料生产和优质烟出口重要县（市），是中国辣椒第一市和长江以北最大的莲菜基地。其中，小麦、烟叶为两大优势，烟叶以“邓片”驰名中外。
家畜、家禽10余类40多个品种，其中，南阳黄牛饲养比重占黄牛总数的95％，年存栏45万头，生猪存栏70万头，家禽1500万只，为河南省南阳黄牛繁育基地之一。山羊饲养量大，皮张品质优良，为河南省山羊板皮基地县（市）之一。还有多种野生动物。
林木资源丰富，矿产较多。林木57科、69属、150多种。
矿产主要有水泥灰岩、熔剂灰岩、电石灰岩（包括方解石、冰洲石、水晶石、重晶石、墨玉大理石等）、高岭土、耐火土及煤、黄铁、镜铁等，多产于西部山区。杏山的石灰岩碳酸钙含量品位高达51％，水泥灰岩储藏量13亿吨，溶剂灰岩2亿吨，电解灰岩2000万吨，黑墨大理石1100万立方米，花岗岩储量600万立方米，是发展建材工业的理想基地。
